OpenAI: 2.000 AI agents ανέλυσαν εγκέφαλο ποντικιού σε 32 λεπτά

Η OpenAI ανακοίνωσε ότι συνεργάστηκε με τις PerturbAI και Scripps Research για να αναλύσει έναν μεγάλο γενετικό άτλαντα εγκεφάλου ποντικιού σε μόλις 32 λεπτά, χρησιμοποιώντας σχεδόν 2.000 AI agents. Η ομάδα εκτιμά ότι η ίδια εργασία θα απαιτούσε από μήνες έως έναν χρόνο, αν γινόταν αποκλειστικά από ανθρώπους ερευνητές.

Οι agents δεν αντιμετώπισαν το dataset ως ένα ενιαίο ερώτημα. Ο καθένας ανέλαβε μία γονιδιακή αλλαγή, μελέτησε την αντίδραση των κυττάρων, αναζήτησε σχετικές επιστημονικές δημοσιεύσεις και πρότεινε πιθανές εξηγήσεις. Τα επιμέρους πορίσματα ενώθηκαν στη συνέχεια σε έναν ενιαίο «reasoning atlas», ο οποίος συνδέει γονίδια, κυτταρικές επιδράσεις, μελέτες και πιθανούς μηχανισμούς.

Η υποδομή βασίστηκε στο GPT-Rosalind της OpenAI, μοντέλο σχεδιασμένο για έρευνα στις βιοεπιστήμες. Τα δεδομένα προέρχονται από έναν whole-brain CRISPR atlas της PerturbAI. Με το CRISPR απενεργοποιήθηκαν μεμονωμένα γονίδια σε ποντίκια, ώστε να καταγραφεί πώς κάθε αλλαγή επηρεάζει διαφορετικούς τύπους εγκεφαλικών κυττάρων.

Η OpenAI αναφέρει ότι η προσέγγιση αναπαρήγαγε ευρήματα προηγούμενων ανθρώπινων αναλύσεων και αποκάλυψε νέες ερευνητικές κατευθύνσεις. Σε τυφλές δοκιμές, ειδικοί προτίμησαν τις αναφορές που προέκυψαν από το σύστημα πολλών agents έναντι εκείνων ενός μεμονωμένου agent στο 75% των περιπτώσεων.

Ένα από τα παραδείγματα αφορά τα Tsc1 και Tsc2, δύο γονίδια που σχετίζονται με τον έλεγχο της κυτταρικής ανάπτυξης. Η απενεργοποίηση του Tsc2 άλλαξε δεκάδες γονίδια που συνδέονται με την επικοινωνία των νευρικών κυττάρων στην παρεγκεφαλίδα, ενώ η αντίστοιχη αλλαγή στο Tsc1 είχε περιορισμένη επίδραση. Η διαφορά μπορεί να έχει σημασία για τη μελέτη της tuberous sclerosis, μιας σπάνιας γενετικής διαταραχής.

Σε διαφορετική περίπτωση, η απενεργοποίηση του Dctn1, γονιδίου που συνδέεται με τη σπάνια νόσο Perry syndrome, αύξησε τη δραστηριότητα γονιδίων που παράγουν χοληστερόλη. Οι agents πρότειναν εργαστηριακά πειράματα για να εξεταστεί αν η συγκεκριμένη μεταβολή συμμετέχει στη βλάβη των νευρικών κυττάρων. Εδώ βρίσκεται η πιο χρήσιμη πλευρά του εγχειρήματος: όχι μια αυτόματη διάγνωση, αλλά η ταχύτερη διαμόρφωση ελέγξιμων υποθέσεων.

Το αποτέλεσμα δεν αποτελεί ακόμη αξιολογημένη επιστημονική δημοσίευση. Η σχετική εργασία έχει αναρτηθεί ως προδημοσίευση στο bioRxiv και δεν έχει περάσει από αξιολόγηση ομοτίμων, άρα τα ευρήματα και οι προτεινόμενοι μηχανισμοί χρειάζονται ανεξάρτητη επιβεβαίωση.

Ο reasoning atlas είναι διαθέσιμος στο GitHub, ενώ το υποκείμενο dataset έχει αναρτηθεί στο Hugging Face. Το επόμενο βήμα δεν είναι να αντικατασταθεί ο ερευνητής, αλλά να ελεγχθούν στο εργαστήριο οι υποθέσεις που γεννήθηκαν από την ανάλυση των agents.

Η σύνταξη του άρθρου υποστηρίχθηκε από εργαλεία AI και το περιεχόμενο ελέγχθηκε σύμφωνα με τη συντακτική πολιτική του TechitNews.